Der Bereich Bioenergie befindet sich weiterhin im Wachstumsprozess: Nach vorläufigen Zahlen des Bundesverbands BioEnergie konnte der Bioenergiemarkt in Deutschland auch in 2009 seinen Marktanteil am Endenergieverbrauch von 6,8 Prozent in 2008 auf 7 Prozent steigern. Damit stellt die Bioenergie einen Marktanteil von 70 Prozent der gesamten in Deutschland erzeugten erneuerbaren Energien.

Insbesondere die Stromproduktion aus biogenen Rohstoffen wuchs um einen Prozentpunkt auf 5,2Prozent in 2009, was 32 Prozent der gesamten erneuerbar erzeugten Strommenge entspricht. Auch im Wärmemarkt konnte ein Marktwachstum von 7,3 Prozent in 2008 auf insgesamt 7,7 Prozent der Wärmenachfrage in 2009 erzielt werden. Die Biowärme stellt somit 92 Prozent der gesamten in Deutschland aus erneuerbaren Energien erzeugten Wärme zur Verfügung.

Dem stehen jedoch wie im Vorjahr deutliche Rückgänge im Absatz biogener Kraftstoffe im Verkehrssektor entgegen. Ihr Marktanteil ging deutlich von rund 7,2 Prozent in 2007 auf  5,9 Prozent in 2008 und nun nur noch 5,5 Prozent in 2009 zurück. Der Grund dafür ist nach Angaben des Verbands die Besteuerung von Biodiesel und Pflanzenöl.